汉尼拔成功地绕过了试图阻止他过境的当地人，然后通过转向罗纳河（Rh?ne）山谷，避开了从地中海沿岸行进的罗马军队。
他穿越阿尔卑斯山的确切路线自此成为学术争论的源头（波利比乌斯 [polybius]，关于汉尼拔战役的最早幸存古代记载，报告称该路线已经存在争议）。
现代影响力最大的理论支持两条路线：
一是沿德罗姆河（dr?me）山谷行进，并在现代公路南侧的蒙日维尔山口（col de montgenèvre）穿越主山脉；
二是进一步北上，沿伊泽尔河（Isère）和阿克河（Arc）山谷，穿越靠近现代的蒙特塞尼山口（col de mont cenis）或小圣伯纳德山口（Little St bernard pass）。
最近的证据表明，汉尼拔的军队在马特洪峰（matterhorn）附近经过。
斯坦福大学的地质考古学家帕特里克·亨特（patrick hunt）认为汉尼拔选择了克拉皮耶山口（col de clapier），声称该山口最准确地符合古代对路线的描述：可以看到意大利的广阔视野、全年积雪的区域和一个大型营地。
其他学者对此表示怀疑，提出汉尼拔走了更容易的路线，穿越小蒙特塞尼山口。
亨特对此回应，认为汉尼拔的凯尔特向导故意误导了这位迦太基将军。
最近，w. c. 马哈尼（w. c. mahaney）认为克拉维尔山口（col de la traversette）与古代作者的记录最为贴合。
生物地层考古数据强化了克拉维尔山口的案例.
对该山口两侧水流附近的泥炭沼泽进行分析显示，地面被“成千上万，甚至数万只动物和人类”严重干扰，土壤中含有与马和骡子消化道相关的独特克劳斯特里迪亚（clostridia）细菌痕迹。
放射性碳测年确认了2168 bp或约公元前218年，即汉尼拔进军的年份。
马哈尼等人得出结论，这一证据以及其他证据强烈支持克拉维尔山口为“汉尼拔路线”，正如加文·德·比尔（Gavin de beer）在1954年所主张的那样。
德·比尔是唯一三位考察过所有阿尔卑斯高山口的解读者之一（其他两位为约翰·拉岑比（John Lazenby）和雅各布·塞贝特（Jakob Seibert）），他们对哪条路线最为合理提出了看法。
德·比尔和塞贝特均选择克拉维尔山口，认为其最接近古代描述。
波利比乌斯写道，汉尼拔跨越了最高的阿尔卑斯山口：克拉维尔山口，它位于上吉尔河谷（upper Guil valley）和上波河（upper po river）之间，是最高的山口。
此外，正如瓦罗（Varro）在《农业论》（de re rustica）中所述，克拉维尔山口是西阿尔卑斯地区最高的，也是最南的。
马哈尼等人认为，德·比尔用来支持克拉维尔山口的因素包括“将古代地名与现代名称进行比较，仔细分析主要河流的洪水时间以及远眺波河平原”，加上来自山口两侧的冲积沉积物的大规模放射性碳、生物和寄生虫证据，提供了“支持证据，若你愿意，可以称为证据”，证明汉尼拔的入侵确实沿这条路线进行。
如果汉尼拔确实走了克拉维尔山口，从山口的最高点可以看到波河谷，证实了波利比乌斯的记载。
根据李维（Livy）的记载，这次跨越是在巨大的困难面前完成的。
汉尼拔通过智慧克服了这些困难，例如他用醋和火来突破岩石塌方。
根据波利比乌斯的说法，他抵达意大利时仅带着20,000名步兵、4,000名骑兵和只有几头大象。
李维提到的火灾岩石塌方事件仅波利比乌斯没有提及此事，且在西阿尔卑斯的唯一两个层次的岩石塌方中（位于克拉维尔山口下方）没有发现碳化岩石的证据。
如果波利比乌斯关于他越过罗纳河后所指挥的部队人数是正确的，这表明他几乎损失了一半的兵力。
历史学家如谢尔盖·兰塞尔（Serge Lancel）质疑他离开伊比利亚时的部队人数的可靠性。
从一开始，汉尼拔似乎就意识到他必须在没有伊比利亚援助的情况下作战。
汉尼拔对军事事务的看法部分源于他的希腊教师的教导，部分源于与他父亲一起获得的经验，这一视野延伸至他所处的希腊化世界的大部分地区。
他广阔的视野催生了他通过打开北方战线、征服半岛上的同盟城邦，而非直接攻击罗马的宏大战略。
导致迦太基在第一次布匿战争中失败的历史事件，以及他父亲指挥迦太基军队时的经历，使汉尼拔策划了通过陆路穿越阿尔卑斯入侵意大利的计划。
这项任务涉及动员60,000至100,000名士兵和训练一支战争大象军团，所有这一切都必须在途中补给。
阿尔卑斯对意大利的入侵是一场将震撼公元前218年的地中海世界的军事行动，其影响持续了二十多年。
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汉尼拔艰难的行军使他进入了罗马领土，并挫败了敌人在外国土地上解决主要问题的尝试。
他突然出现在波河谷（po Valley）的高卢人中，使得这些部落在罗马人能够采取措施制止叛乱之前就脱离了对罗马的新效忠。
普布利乌斯·科尔内利乌斯·西庇阿（publius cornelius Scipio）是负责指挥拦截汉尼拔的罗马军队的执政官，同时也是西庇阿·非洲（Scipio Africanus）的父亲。
他并没有预料到汉尼拔会尝试跨越阿尔卑斯山，因为罗马人准备在伊比利亚半岛展开战争。
在高卢仍有小股部队驻扎的情况下，西庇阿试图拦截汉尼拔。
他通过迅速决策和迅速行动，成功将军队通过海路运送到意大利，及时与汉尼拔会合。
汉尼拔的部队穿过波河谷，并参与了提基努斯战役（battle of ticinus）。
在这里，汉尼拔凭借其优秀的骑兵迫使罗马军队撤离伦巴第平原（plain of Lombardy）。
这场胜利虽然微小，却激励了高卢人和利古里亚人加入了迦太基的事业。
他的部队人数回升至约40,000人。
西庇阿重伤，幸得其勇敢的儿子骑马返回战场救下父亲，才保住了性命。
西庇阿最终撤退到特雷比亚河（trebia）以南，营地设在普拉森提亚（placentia），军队基本完整。
另一支罗马执政军队迅速赶往波河谷。
在提基努斯战役的败局消息尚未传到罗马之前，参议院已命令执政官提贝里乌斯·塞姆普罗尼乌斯·隆古斯（tiberius Sempronius Longus）将军队从西西里岛召回，以与西庇阿会合并面对汉尼拔。
汉尼拔凭借灵巧的机动，处于拦截他的有利位置，因为他位于普拉森提亚与阿尔米努姆（Arminum）之间的直接道路上，而塞姆普罗尼乌斯必须沿此道路行军以支援西庇阿。
随后他占领了克拉斯蒂迪乌姆（clastidium），为士兵们获取了大量补给。
但这一收获并非没有损失，塞姆普罗尼乌斯避开了汉尼拔的监视，绕过他的侧翼，成功与同僚汇合在特雷比亚河附近的营地。
在同年的十二月，汉尼拔在特雷比亚战役中展现了他的军事才能，在削弱了罗马优越步兵后，利用突然袭击和侧翼伏击将其击溃。
然而，他的大多数或全部战争大象在寒冬中因受伤或寒冷而死，未能参加随后的特拉西梅诺湖（Lake trasimene）和坎尼战役（cannae）。
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汉尼拔将他的军队安置在高卢人中度过冬季，但高卢人对他的支持减弱。
为了防止高卢盟友对他实施暗杀，汉尼拔制作了多顶假发，染成不同年龄的样子，并不断更换，以便任何潜在的刺客都无法认出他。
公元前217年春，汉尼拔决定向南寻找更可靠的基地。
罗马的新执政官格奈乌斯·塞尔维利乌斯（Gnaeus Servilius）和盖乌斯·弗拉米尼乌斯（Gaius Flaminius）预计汉尼拔将进攻罗马，他们带着军队封锁了汉尼拔可能使用的东、西路线。
通往中意大利的唯一替代路线是阿尔诺河（Arno）河口。
这个地区几乎是一片巨大的沼泽，在这个季节特别泛滥。
汉尼拔知道这条路困难重重，但它仍然是通往中意大利最快且最可靠的路径。
波利比乌斯（polybius）声称，汉尼拔的军队在“在水中行军”的土地上走了四天三夜，饱受疲劳和缺乏睡眠之苦。
他在没有遭遇抵抗的情况下越过了亚平宁山脉（Apennines），但在阿尔诺的沼泽低地失去了大部分兵力。
他于公元前217年春到达埃特鲁里亚（Etruria），并决定通过摧毁弗拉米尼乌斯所负责保护的地区来引诱罗马主力与他交战。
正如波利比乌斯所述：“他（汉尼拔）计算，如果他越过营地，进入后方地区，弗拉米尼乌斯（部分出于对民众指责的恐惧，部分出于个人的烦恼）将无法忍受静观国家的毁灭，而主动跟随他……并给予他攻击的机会。”
与此同时，汉尼拔试图通过证明弗拉米尼乌斯无法保护罗马的盟友来瓦解他们的忠诚。
尽管如此，弗拉米尼乌斯仍然在阿雷提姆（Arretium）被动驻扎。
汉尼拔大胆绕过弗拉米尼乌斯的左翼，未能通过破坏引诱他交战，成功切断了他与罗马的联系，执行了军事史上首次记录的转动战术。
他随后穿过埃特鲁里亚的高地，激怒弗拉米尼乌斯急于追击，并在特拉西梅诺湖（Lake trasimene）的一个山口捕捉到了他。
在那里，汉尼拔在湖水或邻近的坡地上消灭了弗拉米尼乌斯的军队，并杀死了弗拉米尼乌斯。
这是罗马人遭遇的最惨重的伏击，直到与帕提亚帝国的卡拉海战役（battle of carrhae）之前。
汉尼拔现在已消灭了唯一能阻止他向罗马进军的战场力量。
他意识到没有攻城器械，无法希望攻占首都。
于是他决定利用胜利，进入意大利中部和南部，鼓励对主权力量的全面叛乱。
罗马任命昆图斯·法比乌斯·马克西穆斯·维鲁库苏斯（quintus Fabius maximus Verrucosus）为独裁官。
法比乌斯偏离了罗马的军事传统，采取了以他命名的策略，避免正面战斗，同时在汉尼拔附近部署几支罗马军队，以监视和限制他的行动。
汉尼拔在阿普利亚（Apulia）肆虐，但未能使法比乌斯与他交战，因此决定穿越萨姆尼乌姆（Samnium）前往坎帕尼亚（campania），这一意大利最富饶的省份，期望破坏能够引诱法比乌斯参战。
法比乌斯紧随汉尼拔的破坏路线，但仍然拒绝脱离防御。
这一策略在许多罗马人中并不受欢迎，他们认为这是一种懦弱的表现。
汉尼拔认为在已经被摧毁的坎帕尼亚低地过冬是不明智的，但法比乌斯通过确保所有出路被封锁，使他陷入了困境。
这导致了阿格尔·法莱尔努斯（Ager Falernus）之夜战斗。
汉尼拔让他的士兵将燃烧的火把绑在一群牛的角上，驱赶它们向附近的高地。
部分罗马人看到这一移动的光柱，误以为是汉尼拔的军队正沿高地逃脱，便追赶上去。
随着他们追逐这个诱饵，汉尼拔则在黑暗的低地默默移动自己的军队，成功到达一个无人看守的山口。
法比乌斯本人距离汉尼拔很近，但这次他的谨慎反而对他不利，正确地察觉到这是一个圈套，他选择了不动。
因此，汉尼拔成功悄然带着整个军队逃脱。
正如阿德里安·戈德斯沃西（Adrian Goldsworthy）所说，汉尼拔成功撤退的行动“成为古代将领的经典，几乎出现在每一篇战争的历史叙述中，并被后来的军事手册所引用。”
这一事件对法比乌斯的声望造成了严重打击，他的独裁权力不久后就结束了。
冬季来临时，汉尼拔在阿普利亚平原找到了舒适的驻扎地。