于是，在明知袁崇焕人在双岛的情况下，为表议和诚意和其急迫之心，二十七日，皇太极再遣图鲁什带书信前往宁远。
曰：金国汗致书於大明国袁大人。因喇嘛迟久未归之故，曾遣人致书一次。据逃人来告，尔之议和是假等语。此系逃人之言。由尔处逃来之人，肯言尔之善乎？由此逃去之人等肯言我之善乎？遂未信之。今获奸细卞子兴，讯问之，亦称和好是假，羁留喇嘛不遣等语。我思之，逃来之人故意诬告之事，岂奸细亦行诳诈耶？若信其言，此等小人，和与不和之大事，何得而知？若不信，则至此时，出使之人何无一信来报？恐其事已实，故遣此人持书往之。我本诚心欲和，是以致书往。人或可欺，天可欺乎？尔等本无诚意乎？不则听何谗言耶？若不遣还去使，其数人之增减，无碍大局，若失信义，则人将不复信矣！天意亦愿息兵而享太平，去奸伪而行忠信也。倘厌太平而愿兵戈以弃忠信而尚奸伪，则孰是孰非，唯天鉴之。
［双岛］
六月初五，袁崇焕在双岛山峦设帷帐，邀请毛文龙前来观阅将士们射箭。在细数了毛文龙的十二桩该斩的罪状，跪地磕头向皇上请旨后，以肃军纪为名，执尚方宝剑将毛文龙斩首于帐前。
三军一片哗然，但慑于袁崇焕的威严，无人敢动。
第二日，袁崇焕下令厚葬毛文龙，并以酒肉为祭，在坟前涕泗横流，道：“昨日杀你，是国有国法，按律而行；今日祭奠，则是出于同僚之情。”并传话三军：“我只杀毛文龙一人，以儆效尤，其部下皆无罪。”
毛文龙一死，其部下士兵二万八千人乱作一团，群龙无首，于是袁崇焕设置了四位共协首领，分别是毛文龙之子毛承祚、副将陈继盛、参将徐敷奏以及反叛归明的游击刘兴祚。将原先毛文龙的敕印、尚方宝剑交由陈继盛代他掌管。又犒劳军士，传檄安抚各岛民众，废除了毛文龙先前所制苛政。
这天夜里，海兰珠独自一人去了海岸，坐在一块礁石上对月冥思。
杀毛文龙容易，但这身后事却不易。袁崇焕得把这个烂摊子收拾妥当，安抚住他的余部，以防叛乱，还得想着如何禀告崇祯帝，定是焦头烂额了，哪里还会有闲情顾及她呢？
“别来无恙――”
身后突然传来一声熟悉的问候，只见身着大明戎装的刘兴祚一墩身，席地而坐在她身旁。
她倒是不讶异，只道：“伍子胥，别来无恙。”
刘兴祚摘了一根狗尾草，在手中摆弄，“我哪里算得上是伍子胥，不过是愿为这天下万万的汉人，献微薄之力罢了。”
“为了天下大义，自私的抛下家人，真的值得吗？”
她不免感叹，皇太极一旦知晓了他用“狸猫换太子”之计叛逃投明的始末，一定不会放过他的家人。
“国家危难，民族存亡之际，我身为汉人，不仅毫无作为，多年在金国苟且偷生，还要帮着胡人手刃同胞，我刘兴祚……实在无颜对列祖列宗。我自知不是个忠孝之人，但我母亲她……”说到此处，他几近哽咽。
海兰珠叹息一声，心生恻隐，“如果我能回去沈阳的话，一定向汗王求情，以免其死罪……”
刘兴祚与她作一揖道：“多谢。”
她吹着海风，望着海上生明月的景致，格外惆怅。
“汗王他……还好吗？”
两年了，她所能得知的消息，只有金国动辄出兵讨伐了察哈尔之类的军事动作而已。
“算是好吧。去年添了两位格格，还有一位阿哥，不过那侧妃当即就被赏赐给了大臣为妻……”
刘兴祚没有多说其他细枝末叶的事情，只道：“你既如此记挂，不如向袁公求情，我想他是会答应的。”
海兰珠望着幽蓝的海面，摇头答：“他若真的肯放我走，两年前就这么做了。”
“两年，江山也可以易主，何况是人心呢？很多事情是会变的。”
刘兴祚意味深长地说道：“这两年，袁公待你不薄，若是当时你落在了毛文龙手上，恐怕不会过得这般惬意。”
海兰珠微愣，不知他言下何意。
“几日夜巡，我都瞧见袁公独自一人在屋外赏月，不肯入屋就眠，只怕是为了不惊扰你罢……”
刘兴祚将那狗尾草递给她，长叹一声。
“袁公本不是温柔人，却为你做尽了温柔事。你当是知足了。”
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七月，袁崇焕一行返航回到宁远，马不停蹄地上奏京师毛文龙一案始末，并请罪自罚。
崇祯得知毛文龙被杀后，大吃一惊，却也没有轻易责怪袁崇焕，而是褒赏了他此举，并公开毛文龙所犯罪行，传旨法司，逮捕毛文龙余部，对于袁崇焕在皮岛的将领安排也表示准许。
然而毛文龙死后，皮岛无帅，人心向背，以至于不少人背叛投敌去了。袁崇焕害怕这些毛文龙的部下会暗谋兵变，又向崇祯请旨增补十八万两军饷，以安抚士卒。崇祯虽然不悦，但最后还是点头答应了。
他们离开的这三个月，皇太极一连写了三封信来，每一封都开诚布公地说要如何议和，提出划定国界而休战。
袁崇焕看过之后，是直叹皇太极的异想天开。
这辽东大地，本就是大明国土，自然是一寸也不能割让，于是他想也未想，便写信回绝了划定国界之请求。
［盛京］
七月初三日，白喇嘛和郑信赍书两封回到盛京，而袁崇焕并未再遣使臣而来。
信中写：奉帝命巡边调兵之兵部尚书袁复书於汗陛下。汗致书遣喇嘛来，以追述前好。再者，书有仰赖皇天，和好相处一语，唯鬼神知之。我国幅员九州，即失一辽东，何足为惜。况其地原非汗所有。辽东人西来，而其填基均在於彼，我强压其思念先骨之情，可乎？亦不合众意。止有受而不可言，故未奏帝知之。至礼遇往来之人，为尔国尊卑之故。我皇上宽宏明智，从不分尊卑。汗若以名誉为念，治理一切事务，以道义为规矩者，则尔自去察哈尔腥臊也。即使中国亦以礼义相待耳！至封印之语，皆非一言可尽者也。
奉帝命巡边调兵之兵部尚书袁复书於汗陛下。展阅来书，知汗敬天好生之诚心，汗若如此，则求於天可也。唯天道无偏，曲直分明。与其求诸天，莫如先求於心。天道唯移也。使臣来时我出海，是以久留，别无他事。
皇太极读过信后，便问那白喇嘛：“之前本汗要你口头转达的话，袁崇焕作何回应？”
“袁崇焕说，该说的，他都写在信上了。至于汗王想要之物，如今另属他人，所谓‘等闲却变故人心，却道故人心易变’。正如信中所言，与其求诸天，莫如先求於心……请汗王勿再妄自尊大，执迷不悟。”
范文程在场听到那句“等闲却变故人心，却道故人心易变”，不由觉得凉意嗖嗖。
袁崇焕……当真是嚣张，当真是没把皇太极放在眼里。
“欺人太甚！”
皇太极咬牙说了这四个字，将那书信摔在地上，正在作实录的达海巴克什忙不迭去捡了起来。
“他要这样蹬鼻子上脸，不识抬举也好，不过是早些送他上路罢了――”皇太极当即决断道：“来人――速去把三大贝勒请来，本汗要商议征明！”
代善、莽古尔泰和阿敏赶来后，一听到要征明，当即提出了异议。
“大汗，咱们才在宁远吃了败仗，未得喘息，眼下又要大举征明，只怕不妥……”
代善言罢，莽古尔泰也接着说道：“宁远城坚，不易攻，不如趁机先取东江为好――大汗也知道，那明军的大炮可不是闹着玩儿的！”
底下众臣议论纷纷，但大部分都是持反对意见，只有岳托和济尔哈朗坚持站在皇太极这边。
皇太极根本没把代善和莽古尔泰的谏言听进去，只问范文程道：“范学士觉得如何？”
范文程答了八个字：“趁热打铁，事不宜迟。”
“本汗正是此意。子曰：无欲速，无见小利。欲速则不达，见小利，则大事不成。这两年来本汗一心放长线以钓大鱼，如今到了收网之最佳时刻。”皇太极神色凌厉，“本汗要让袁崇焕知道，什么叫做釜底抽薪。”
初十日，为麻痹袁崇焕方，隐藏作战意图，皇太极还是照旧给袁崇焕回了一封信。
其通篇都在聊辽金元之历史。并言：“夫天下者，非一人之天下，乃众人之天下也。天赐与谁，则谁得之。当年金国欲与大辽和好，然而辽妄自尊大而不从，结果不还是吃了败仗才被迫和好了吗？大明若是不吸取前人之教训，也会有辽金元一般的下场。你们一而再再而三地无视我堂堂大金国汗，视大明皇帝为天子，甚至不肯将本汗的议和之情奏报与大明皇帝知晓，已是欺人太甚，简直比大辽当年欺辱金国之举更有甚之。既然如此，本汗也不再强求议好，尔等好自为之。
十六日，袁崇焕回信。见皇太极有意翻脸，罢和谈，便又故伎重施，在信中百般寻找推辞，以‘议和为大事，不可三言两语而了结，忘大汗深思熟虑’来拖延时间。
十八日，皇太极写了最后一封给袁崇焕的致信。曰：我诚心和好，可你自大不从，谅天亦鉴之，人亦闻之矣！
八月起始，盛京便开始紧锣密鼓地开始了征明备战。
庚午，在伐明之前，皇太极颁布了八旗临阵赏罚令。
乙亥，皇太极决议在金国上下举行文试，以振兴文教。提出“当以武功戡乱，以文教佐太平”的政治远略。懿旨道：“自古及今，文武并用，以文治世，以武克敌。本汗今欲振兴文教，试录生员。”
无论是满人、汉人抑或是蒙古人，只要俱令赴试，有才之人统统能得以录用，为官为仕。
此举不仅一改从前□□哈赤所制，汉人为婢为奴，不从则杀之的恶政。更是施以仁政治国，提高汉人的地位，意在缓解金国内在的民族文化冲突。并勒令儒臣翻译汉文书籍，极力推崇汉人之文化。
九月壬午朔，初试生员，提拔出了二百余人，赏缎布有差，并免其差徭。
癸未，令贝勒济尔哈朗、岳托等前去略明锦州、宁远以作诱敌之试探，并焚毁明军积蓄粮草。
十月初二，皇太极在盛京誓师十万，绕开了袁崇焕驻守的宁锦防线，而北上取道蒙古。以蒙古喀喇沁部骑兵为向导，亲率八旗大军，突袭明长城蓟镇隘口龙井关和大安口，破墙入塞，挥师直指京师。
明朝举国震惊，崇祯闻讯，畿辅震动，诏令天下将士，入京勤王。
作者有话要说：史料补注：六月五日这天袁崇焕邀请毛文龙来观看将士们射箭，先在山上设了帷帐，命令参将谢尚政等安排身穿铠甲的士兵埋伏在帐外。毛文龙来后，他手下的士兵不能进帐里来。袁崇焕说：“我明天出发，海外的事情全寄托在您身上了，请受我一拜。”互相拜见之后，一起登上山来。袁崇焕问起他随从军官的姓名，多是姓毛的。毛文龙说：“这些人都是我的孙子。”袁崇焕笑了，说道：“你们在海外劳苦多日，每月禄米也只有那么一斛，说起来痛心呢，也请受我一拜，大家都为国家尽力。”这些人都叩头道谢。
袁崇焕就此诘问毛文龙几桩违令的事情，毛文龙做了对抗性的辩解。袁崇焕高声喝斥他，让人扒下他的帽子和袍带，把他捆了起来，毛文龙仍很倔强。袁崇焕说：“你有十二条该斩头的大罪，知道吗？按我朝祖宗定下来的制度，大将领兵在外，必须接受文官的监视。你在这边一人□□，军马钱粮都不接受核查，一该杀。大臣的罪没有比欺骗君主更大的，你送上奏章全都蒙骗，杀害投降的士兵和难民，假冒战功，二该杀。大臣没有自己的将领，有则必杀。你上书说在登州驻兵取南京易如反掌，大逆不道，三该杀。每年饷银几十万，不发给士兵，每月只散发三斗半米，侵占军粮，四该杀。擅自在皮岛开设马市，私自和外国人来往，五该杀。部将几千人都冒称是你的同姓，副将以下都随意发给布帛上千匹，走卒、轿夫都穿着品官官服和袍带，六该杀。从宁远返回途中，劫掠商船，自己做了盗贼，七该杀。强娶民间女子，不知法纪，部下效仿，使得百姓不安于家，八该杀。驱使难民远远去帮你盗窃人参，不听从的就被饿死，岛上白骨累累，九该杀。用车送金子到京师，拜魏忠贤为父，并在岛上雕塑他加冕冠的肖像，十该杀。铁山一战败北，丧师不计其数，却掩败为功，十一该杀。设镇八年，不能收复一寸土地，坐地观望，姑息养敌，十二该杀。”宣布完后，毛文龙丧魂失魄，说不出话来，只是叩头请免他一死。袁崇焕召他的部将来说：“毛文龙这样的罪状，该不该杀他？”大家都怕得唯唯诺诺，谁敢反对？中间有称道毛文龙数年劳苦的，袁崇焕训斥说：“毛文龙本是一个平民百姓罢了，官做得最高，全家都得以荫封，足够报他的辛劳了，他怎么就这样悖乱违逆呢！”接着就磕头请求皇帝的旨意说：“我今天杀毛文龙以整顿军纪。将领中间有和毛文龙一样的，都要杀了他们。我不能成功的话，请皇上也像杀毛文龙一样杀了我。”于是取下尚方宝剑在帐前把毛文龙的头砍了下来。出来告诉他的将士们说：“只杀毛文龙一个人，其他人都没有罪。”
袁崇焕斩毛文龙后，可说是为后金长驱南下解除了后顾之忧，三个月后就发生了后金兵临北京城下的“己巳之变”――后金约十万精兵绕道内蒙古，由喜峰口攻陷遵化，直迫明都北京。