玛奥微笑着向小智介绍：“这里是宝可梦学校。”小智环顾四周，惊讶地说：“哦，宝可梦学校啊，原来在这里。误打误撞的到地方了!”玛奥看着小智迷茫的样子，忍不住笑了：“原来你迷路了，走吧，我给你带路吧！这边这边。”小智有些尴尬：“不用拽我了，我自己会走。”他轻轻挣脱了玛奥的手，跟在她身后。
在学校内，玛奥带着小智参观各个设施，小智对一切都充满了好奇：“哇，这是什么啊，好酷啊。”玛奥耐心地解释：“这里是学校啊，是学习宝可梦知识的地方。”她带着小智来到校长室，并敲了敲门：“校长先生，我给您带来了一位新生。”小智连忙解释：“不不不，你搞错了，我不是新生。”校长室的门开了，花子和吸盘魔偶走了出来。
花子看到小智，有些惊讶：“小智!你居然可以自己一个人找到这里来。”小智看到妈妈，也感到意外：“妈妈!”这时，大木博士的表弟，大木成也，从校长室里走了出来：“阿罗拉，小智，欢迎来到宝可梦学校。”小智有些迷惑：“大木博士？”成也笑着解释：“哈哈哈，大伙都说我和雪成两个人长得很像。我叫大木成也，请多指教!”
小智随后跟着走进来校长室，和智妈他们分享了所见的事。这时，成也打开了和大木雪成的通讯。成也对着通讯器说：“雪成，是我，蛋已经送到了，你放心吧！”雪成的声音从通讯器里传来：“成也，顺利送到啦，谢谢你啦，小智。”“对了成也，让小智在你那边呆一段时间吧，怎么样。他刚从卡洛斯地区旅行回来不久，还参加过石英大会，城都大会，卡洛斯大会等等。他还是卡洛斯大会的优胜，让他在你那当对战陪练怎么样，顺便还能磨砺磨砺他。”
成也看了看小智，然后回答雪成：“可以啊，小智你的事情我听说了，你愿意在这里留一段时间吗？”小智陷入了思考，看着皮卡丘，他知道这是一个提升自己的机会。花子也劝他：“小智，你就在这里呆一段时间吧，这么长时间里，你都一直在外旅行，也应该休息休息了，在这里还能学到不少东西呢。”小智想了想，同意了：“好的，妈妈，那我就先留在这里。”成也点了点头：“玛奥，你先带着小智去参观一下学校吧！”玛奥兴奋地回答：“好的，校长。我们走吧小智!”
小智跟着玛奥走了一段路，来到一个房间。玛奥骄傲地介绍：“这里就是我们的教室，我们平时就是在这里上课的。”小智环顾了四周，整齐的课桌椅和书本摆放，还有能远眺的窗台，他不禁赞叹：“这里很棒啊，很让人舒心。”小智正感受着这里的风情，突然一位裸露着上半身的大汉走了进来，他热情地打招呼：“二位，阿罗拉”玛奥尊敬地称呼他：“库库伊博士!”小智有些惊讶：“博士？”玛奥解释道：“他就是我们的老师，博士他叫小智!”库库伊博士笑着和小智打招呼：“我认识他，卡洛斯联盟大会的优胜者，小智你那在决赛时候的羁绊进化，太让人震惊了。”小智谦虚地回答：“没有啦，我还需要更多的磨炼才行。”库库伊博士友好地说：“小智，我从校长那边听说了，你在接下来的一段时间里，会作为战斗陪练。请多指教哦!”小智也回应道：“好的!”
突然，校门口出现了一伙人，穿着就像不良少年一样，与之相对的另外一位男子。不良少年威胁道：“你这家伙竟敢拦住我们的摩托车，胆子不小啊。挡我们骷髅队的人就是找死。”男子毫不畏惧：“霸占道路不走的人不是你们吗。”当两拨人发生争执时，小智他们赶到了校门口。小智看到这一幕，立刻上前制止：“喂，你们在干什么!”他的出现让双方都停下了争执，转而看向了他。小智站在那里，准备介入这场纷争，皮卡丘也站在他的身边，准备随时战斗。
小智站在校门口，面对着一群不良少年和一位勇敢的男子，他的声音坚定而有力：“你们在干什么？”玛奥在他身旁低声解释：“他们是骷髅队，是一伙故意找别人茬的人。强迫别人和他们对战，然后抢走别人的宝可梦。”小智想了想，这和火箭队的作风有点像啊。他挺身而出：“那我们，应该阻止他们。”
小智刚想上前，那位男子就发话了：“看来今天要给你们一点教训了，最好不要后悔你们刚才说的话。”不良少年们嘲笑着：“我们还没后悔过呢，出来吧夜盗火蜥，超音蝠，猫鼬少。”他们不讲武德地放出了9只宝可梦，并且十分嚣张地看着男子。
就在这时，小智跑了出来，他的声音充满了正义：“你们这样实在是太卑鄙了，皮卡丘我们不能放任不管!”他转向那位男子：“我来帮你，你叫什么名字!”男子回答：“我叫卡奇，不过我不需要你帮忙。”小智一脸懵，但是还是决定帮他一把：“上吧，皮卡丘，就决定是你了。”卡奇看了小智一眼：“你可别逞强，出来吧，爆焰龟兽。”
小智惊讶地看着这只没见过的宝可梦：“哇，这是没见过的宝可梦呢，我的图鉴呢，诶！我好像还没有啊。”卡奇解释道：“他是我的搭档，有龙，火两种属性。”不良少年命令他们的宝可梦：“猫鼬少，咬住。夜盗火蜥，毒液冲击。超音蝠，吸血!”小智迅速指挥：“皮卡丘，使用十万伏特”卡奇也命令：“爆焰龟兽，防守”可是不良少年的宝可梦还没攻击到爆焰龟兽，就被皮卡丘的十万伏特全部击倒在地。
卡奇震惊地看着皮卡丘：“这只皮卡丘好强。”同时，在不远处还有一双眼睛看着小智。正当小智准备乘胜追击时，卡奇拦下了小智：“喂，等一下，接下来交给我们。我们上，爆焰龟兽。使用Z招式，超级无限爆焰弹!”顿时，一道巨大的火球席卷了对面。骷髅队的不良少年们眼看形势不妙，灰溜溜地逃走了。
小智好奇地问：“卡奇，刚才的是什么!”库库伊博士解释道：“小智，是Z招式哦，和卡洛斯地方的mega进化不同，阿罗拉地区的特有技能就是Z招式。”玛玛内赞叹道：“卡奇就是强啊!”水莲也说：“但是小智也不弱啊。”库库伊博士继续解释：“我们这里有四个岛屿，每一个岛屿都有一个守护神宝可梦，只有参加过诸岛巡礼的仪式，并且通过某种考验的人，才能使出这个Z招式哦。”
小智瞬间来了兴趣，他的眼睛闪烁着兴奋的光芒：“这真让人兴奋啊，就和mega进化一样，这里有守护神宝可梦，有诸岛巡礼，还有Z招式。”库库伊博士赞赏地说：“没想到小智你对战能力这么强，当对战陪练实至名归啊。”小智坚定地说：“我的梦想是成为宝可梦大师，所以我还需要更多的锻炼。”
小智说完，感觉后背有人盯着，转身又发现了当初在森林里看到的像蝴蝶一样的宝可梦，随后那宝可梦飞速地钻入树林，消失不见。小智疑惑地问：“那是什么宝可梦啊。”众人疑惑地回答：“哪里有宝可梦啊，小智你看错了吧。”小智挠了挠头：“我看错了吗。”
晚上，花子和小智来到一家阿罗拉风格的餐厅，并且点了很多阿罗拉风格的菜品。花子一边品尝着美食，一边感叹：“真好吃啊，对吧小智。”小智正回想着今天发生的事情，没有听见花子的话。花子关心地问：“小智，你今天是不是发生了什么值得回味的事情。”小智结束回忆，看向妈妈：“没有啦，妈妈。”
此时，一阵尖啸从空中划过，小智连忙看向窗外。只见那蝴蝶状的宝可梦，正立在树干上，看着小智并示意小智跟着他走。小智不断地追随着这只宝可梦的指引，来到一处天台。这只宝可梦从天而降，悬浮在小智面前。小智好奇地问：“你是谁，为什么，只让我看到你!难道你要跟我说什么吗？”
随后这种宝可梦通过心灵感应回应小智：“吾名卡噗鸣鸣，是这座美乐美乐岛的守护神，这只Z手环给你。”小智接过手环，好奇地问：“这就是Z手环吗，那我有了这个东西是不是也可以使用Z招式了。”卡噗鸣鸣回答：“你先带上它，至于能否让你使用它，你还得通过我的试炼。”说完，卡噗鸣鸣就消失了。小智看着手腕上的Z手环，心中充满了期待，他回到了花子那里。
花子担心地问：“小智，你们去哪了，担心死我了。”小智安慰妈妈：“妈妈，没事，就是出去了一趟。”花子关心地说：“你这孩子，真是的，不让人省心。”随后，一行人回到旅馆，没有多说什么就各自休息了。
第二天中午，小智迷迷糊糊地从床上爬起来，看着手腕上的Z手环，瞬间来了精神。他兴奋地想：“这就是Z手环啊，我应该也可以使出像卡奇那样的招式吧。”小智正端详着，门被智妈推开了。花子告诉小智：“小智，我们要和你说件事，家里不能长时间不留人，我和吸盘魔偶，今天下午就要回去了。你就留在这里，在这里还能多交朋友，多学点东西。而且妈妈也已经和校长他们招呼过了，你后面就住在库库伊博士家吧。”
小智有些不舍：“那你们不多玩会了吗，妈妈。”花子温柔地说：“出来旅行很开心，但是家里也要有人看家。你在这里一定要听话哦。”下午，花子和吸盘魔偶乘坐航班返回了关都，而小智则被库库伊博士带回家，并且花了很长一段时间，收拾和摆放自己的物件，准备开始他在阿罗拉地区的新生活。